À propos de Mathilde
Consultante freelance en microbiologie & écologie microbienne — Docteure en pharmacie & Docteure en biologie
Je mets au service de vos projets une double expertise issue d’un cursus pharmaceutique orienté recherche et d’une formation doctorale en microbiologie environnementale. Mon parcours m’a conduite à travailler sur l’écologie microbienne, le métabarcoding et l’analyse de données, avec une pratique approfondie de la bioinformatique appliquée (DADA2, phyloseq, visualisation sous R).
Après une thèse de doctorat et plusieurs expériences de recherche, j’accompagne aujourd’hui laboratoires, startups biotech, bureaux d’études, ONG et institutions publiques dans la conception, l’analyse et la valorisation de leurs données microbiologiques.
Je combine rigueur scientifique, sens de la pédagogie et capacité à produire des livrables clairs, reproductibles et directement exploitables.
Compétences clés :
- Microbiologie environnementale & écologie microbienne
- Métabarcoding, séquençage haut débit, DADA2, phyloseq
- Analyse statistique & visualisation sous R
- Conception d’étude, stratégie d’échantillonnage, accompagnement méthodologique
- Rédaction scientifique : rapports, dossiers, publications
- Communication & vulgarisation scientifique
- Rigueur documentaire issue de la formation pharmaceutique
Prestations :
- Analyse complète de jeux de données microbiologiques / écologiques
- Mise en place ou optimisation de pipelines bioinformatiques (DADA2, phyloseq)
- Accompagnement méthodologique (design d’étude, protocoles, stratégie d’échantillonnage)
- Rédaction / relecture de rapports, dossiers, publications
- Formation & vulgarisation scientifique
Pour qui ?
Laboratoires, startups biotech, bureaux d’études, institutions publiques, projets de recherche, entreprises souhaitant intégrer une expertise microbiologique ou écologique.
Français
Bilingue ou natif
Anglais
Capacité professionnelle complète
Accepte de travailler sur site
Montpellier (jusqu’à 50 km)
Expériences
- MIVEGEC - Team InterHuman Arbovirus Transmission / PhyMedExpResearch intern in virologyjanvier 2021 - juillet 2021 (6 mois)Montpellier, FranceIdentification of the mechanisms involved in muscle chronicity of the Chikungunya virusTasks & techniques: cell culture, infection, viral titration, molecular biology (RNA extraction with or without kit, reverse transcription, qPCR, standard curve production), enzymatic activity assays, work in BLS2 & BLS3Publication: Human muscle cells sensitivity to chikungunya virus infection relies on their glycolysis activity and differentiation stage (Jaquet et.al), Biochimie, March 2024
- Pathogenesis & Chronic infection control - INSERM 1058Research intern in virologyjanvier 2019 - mars 2019 (2 mois)Montpellier, FranceStudy of Usutu and Zika arboviruses tropism in human hostTasks & techniques: cell culture, infection, viral titration, qPCR, immunofluorescence, DNA & RNA extraction, Western-Blot, work in BLS1 & BLS2
- IHPE Perpignan & MIVEGECPhD in Biologyoctobre 2021 - décembre 2024 (3 ans et 2 mois)Montpellier, FranceThe microbiota of intermediate hosts, snails and mosquitoes,vectors of zoonoses under genetic and environmental constraints: an approach to vector capacitySupervised by Olivier REY (IHPE Perpignan) & Thierry LEFEVRE (MIVEGEC)University of Perpignan Via Domitia, Doctoral school 305Tasks & techniques: field work, eDNA (sampling, molecular biology, analysis), camera trap usage, rearing and experimental infections of mosquitoes, molecular biology (DNA and RNA extraction, PCR, reverse transcription, qPCR, MiSeq), work in BSL2 and BSL3, bioinformatic analysis.Publication:Host genetic background more than the environment shapes the microbiota of the snail Bulinus truncatus, an intermediate host of Schistosoma species. (Jaquet et al.) (doi: 10.1111/mec.70318), Molecular Ecology, March 2026.
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Formations
- PhD in BiologyUniversity of Perpignan Via Domitia2024The microbiota of intermediate hosts, snails and mosquitoes, vectors of zoonoses under genetic and environmental constraints: an approach to vector capacity (Supervised by Olivier REY & Thierry LEFEVRE)
- Doctor in Pharmacy (PharmD)University of Montpellier2023PharmD